Entre 2006 y 2021, el CIAEM tuvo una relación estratégica con los Cuadernos de Investigación y Formación en Educación Matemática que edita la Universidad de Costa Rica (cuyo fundador y director durante ese periodo fue Angel Ruiz). En ese periodo Cuadernos publicó números monográficos con trabajos seleccionados de actividades del CIAEM, la Red de Educación Matemática de América Central y El Caribe, y la Comunidad de Educación Matemática de América del Sur.
